Institūta priekšvēsture sākās 1946. gadā, kad Kleistos uz serumstacijas bāzes tika dibināts Latvijas Zinātņu akadēmijas Mikrobioloģijas institūts. 1993. gadā institūta raugu un baktēriju pētnieki nolēma pievienoties Latvijas Universitātei, nodibinot Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas institūtu.

Nodibināts 1993. gadā, atdalot no Latvijas Zinātņu akadēmijas A. Kirhenšteina Mikrobioloģijas institūta.[1] Tā pirmais direktors bija Mārtiņš Beķers.

Galvenie pētījumu virzieni:

  • Rūpniecisko producētāju mikroorganismu metabolisms, fizioloģija un biotehnoloģija
  • Mikrobiālā degradācija un vides biotehnoloģija
  • Pārtikas biotehnoloģija

Direktors

Egils Stalidzāns