Augu šūnu kokultivācija kā virzītājspēks baktēriju biosintētisko gēnu klasteru aktivācijai un evolūcijai.

Projekta nosaukums latviski: Augu šūnu kokultivācija kā virzītājspēks baktēriju biosintētisko gēnu klasteru aktivācijai un evolūcijai 

Projekta nosaukums angliski: Exploring plant cell co-cultivation as a driver of bacterial biosynthetic gene cluster activation and evolution. 

Projekta numurs: lzp-2025/1-0098 

Projekta īstenotājs: Latvijas Universitāte (LU) 

Projekta sadarbības partneri: Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs un Rīgas Tehniskā universitāte 

Projekta vadītājs: Anete Borodušķe 

Projekta īstenošanā vadošā iestāde LU Medicīnas un dzīvības zinātņu fakultāte 

Projekta īstenošanas periods: 01.01.2026. – 31.12.2028. 

Projekta kopējais finansējums: 300 000 EUR, tajā skaitā LU projekta daļai piešķirtais finansējums: 177 000 EUR 

Plānotie projekta rezultāti:  

• divas zinātniskās publikācijas iesniegtas Q1/Q2 izdevumos
• divi ziņojumi zinātniskajās konferencēs
• transkriptomikas un metabolomikas datu kopas deponētas publiskajos repozitorijos
• jauns pētniecības rīks – Streptomyces coelicolor biosintētisko gēnu promoteru-reportieru bibliotēka
• projekta tēmā aizstāvēts maģistra darbs
• informatīvs seminārs par projekta rezultātiem 

Zinātniskā grupa: Anete Borodušķe (LU), Teodors Mincis (LU), Dāvids Fridmanis (BMC), Dita Gudrā (BMC), Ance Roga (BMC), Kristaps Kļaviņš (RTU) 

Informācija par projektu 

Endofīti ir zināmi ar spēju sintezēt bioaktīvus savienojumus un atdarināt saimniekaugu metabolītus, taču mehānismi, kas šo spēju nosaka, joprojām nav skaidri. Šajā projektā tiek pētīts, vai baktēriju un augu šūnu suspensiju kokultivācija var sniegt eksperimentālu ieskatu ķīmiskās mimikrijas mehānismos un atklāt līdz šim neizmantotu baktēriju biosintētisko potenciālu. Projekta mērķis ir izpētīt augu un baktēriju kokultivāciju kā rīku baktēriju biosintētiskās kapacitātes paplašināšanai. 

Darba uzdevumi: 

1. S. coelicolor promotoru–reportieru bibliotēkas izveide, lai noteiktu produktīvākos kokultivācijas apstākļus. 

2. adaptīvās laboratorijas evolūcijas eksperimentu veikšana, lai novērtētu mutāciju biežumu un dabu S. coelicolor genomā kokultivācijā ar augu šūnām. 

3. neaktīvo vai mazaktīvo biosintētisko gēnu klasteru aktivācija, izmantojot transkriptomikas un nemērķētas metabolomikas pieejas. 

Šis pētījums sniegs jaunas fundamentālas zināšanas par endofītu–augu ķīmiskās mijiedarbības pamatmehānismiem un veicinās mikroorganismu resursu pārprofilēšanu pielietojumiem bioaktīvu vielu ieguvē.