Zymomonas mobilis ATFāzes loma superrezistences nodrošināšanā pret antimikrobiālajiem peptīdiem

Projekta nosaukums: Zymomonas mobilis ATFāzes loma superrezistences nodrošināšanā pret antimikrobiālajiem peptīdiem.

Projekta numurs: LU-BA-PG-2024/1-0018

Projekta vadītājs (pēcdoktorants): Reinis Rutkis

Projekta īstenošanas termiņš: 01.09.2024.-31.08.2025.

Projekta kopējais finansējums: 61 380,00 EUR

Projekta mērķis: Projekta mērķis ir noskaidrot H+ atkarīgās F1F0 tipa ATPāzes lomu Z. mobilis superrezistencē pret antimikrobiālajiem peptīdiem.

Projekta rezultāti: iesniegta publikācija – 1, iesniegts projekta pieteikums – 1, Deponēti vismaz 3 rekombinanti Z. mobilis celmi Latvijas Mikroorgnismu kultūru kolekcijā.

01.07.2025. – 31.08.2025.

1. 2025. gada trešajā ceturksnī noslēdzās darbs pie Zymomonas mobilis F0F1 ATFāzes mutantu celmu  raksturošanas:
2. Ir sagatavota un iesniegta publicēšanai publikācija Elsevier žurnālam: Journal of Biotechnology. Raksta nosaukums: "H⁺-ATPase-Linked Bioenergetics Underpin Antimicrobial Peptide Super-Resistance in Zymomonas mobilis" Manuskripta nr: JBIOTEC-D-25-01095.
3. Pieteikta dalība Baltijas mikrobilogu kongresam CBM2025 ar ziņojumu: Fueling the Shield: The Role of F1F0- ATPase in AMP Resistance of Zymomonas mobilis.
4. Z.mobilis celms ΔbapA :: spR. ar inaktivētu  biofilmu saistīto proteīnu A (ZMO0252). tika deponēts LU Mikroorganismu kultūru kolekcijā ar reģistrācijas numuru 1805.

01.04.2025. – 30.06.2025.

2025. gada otrajā ceturksnī turpināts darbs pie pie Zymomonas mobilis F0F1 ATFāzes mutantu celmu  raksturošanas. 

1. Noskaidrota pO2 ietekme uz F0 F1 mutantu celmu augšanu un biotehnoloģiskiem parametriem – augšanas iznākumu Y , specifiskais substrāta patēriņā ātrums q kā arī specifiskais augšanas ātrus m max, papildus apstiprinot ATFāzes aktivitātes lomu biomasas iznākuma samazināšanā.
2. Izdalot membrānu frakciju ir kvantitatīvi novērtēts izejas celmu Zm4, F0 F1 membrānsaistītās ATFžes aktivitāte.
3. Iegūtie dati izmantoti Copasi metabolisma modeļa analīzē.
4. Papildus veikti eksperimenti, lai kvantificētu R2 un R10 peptīdu MIC pret Zm4, F0 un F1 celmiem.
5. Uzsākts darbs pie datu apkopošanas publikācijai.
    

01.01.2025. – 31.03.2025.

2025. gada pirmajā ceturksnī apkopojot iegūtos datus par Zymomonas mobilis F0F1 ATFāzes mutantu rezistenci pret antimikrobiāklaiem peptīdiem, kā arī apkopojot šīs baktērijas fizioloģijas un membrānu fizikāli ķīmisko pētījumu rezultātus tika netieši apstiprināta F0F1 ATFāzes loma rezistence nodrošināšanā.

01.10.2024. – 31.12.2024.

2024. gada pēdējā ceturksnī ir turpināts darbs pie Zymomonas mobilis F0F1 ATPases mutantu celmu fizoloģijas rakstuŗošanas. Ir ievākti pirmējie dati par iegūto celmu fizioloģiju un noturību/rezistenci pret antimikrobiālajiem peptīdiem. Eksperimentālais darbs šo mutantu fizioloģijas raksturošanai tiks turpināts arī 2025 gada pirmajā ceturksnī.

01.09.2024. – 30.09.2024.

2024. gada septembra mēnesī ir izstrādātas/izvēlētas sekvences antimikrbiālo peptīdiem kuri tiks izmantoti lai noskaidrotu  Zymomonas mobilis F0F1 ATPases lomu tās superrezistencē pret antimikrobiālajiem peptīdiem. Sadarbībā ar Max-Planck-Institute for Dynamic of complex technical Systems, Vācija, K. Bettenbrokas grupu ir izveidoti un saņemti Z. mobilis ATPases mutantu celmi pētījumu veikšanai. Ir uzsākts eksperimentās darbs šo mutantu fizioloģijas raksturošanai.