Ģenētiskie marķieri kā liemeņa kvalitātes pazīmju izcilības pamats Latvijas tumšgalves aitu šķirnei

Laika posmā no 2025. gada 1. jūlija līdz 31. decembrim projektā tika veikti sagatavošanās un pētniecīskie darbi. Projekta pirmajos mēnešos tika izstrādāta visa nepieciešamā dokumentācija sekmīgai projekta īstenošanai. Sadarbībā ar Latvijas Aitu audzētāju asociāciju (LAAA) tika panākta vienošanās par fenotipisko datu nodošanu, kā arī uzsākta ilgtermiņa sadarbības līguma izveidošana. Projekta ietvaros tika saņemti fenotipiskie dati par aitu liemeņu gaļas kvalitātes parametriem no iepriekš īstenota pilotpētījuma kolekcijas (LZP projekts Nr. lzp-2021/1-0489).

Šajā periodā tika uzsākta DNS paraugu sagatavošana genotipēšanai, kā arī veikta tirgus izpēte genotipēšanas veikšanai ar SNP čipu. Tika sagatavots sadarbības līgums ar Latvijas Aitu audzētāju asociāciju, kas paredz, sākot ar 2026. gada sākumu, ikgadējā barošanas izmēģinājuma ietvaros nodrošināt asins paraugu un fenotipisko datu sistemātisku ievākšanu. Tika uzsākts asociatīvā analīzes darbs, izmanotot fenotipiskus datus no primārās kolekcijas, sasaistot ar iepriekšējā pilotpētījumā iegūtiem ģenētiskiem datiem un ar liemeņu gaļas kvalitātes rādītājiem.

Projekta rezultāti pārskata periodā tika aktīvi izplatīti zinātniskajā vidē. Tika sagatavotas, iesniegtas un apstiprinātas tēzes dalībai 3rd International Online Conference on Agriculture (IOCAG2025), kas norisinājās 2025. gada 22.–24. oktobrī, un konferencē tika prezentēts mutisks ziņojums par Latvijas tumšgalves aitu šķirnes ģenētisko daudzveidību, balstoties uz viena nukleotīda polimorfismu analīzi. Papildus tika sagatavots, iesniegts un akceptēts abstrakts dalībai The 4th International Online Conference on Animals, kas notiks 2026. gada martā.

Pārskata periodā zinātniskajā žurnālā Agriculture tika iesniegta publikācija par Latvijas tumšgalves aitu šķirnes genoma variāciju un populācijas struktūru salīdzinājumā ar citām Latvijā audzētām šķirnēm, kura ir izgājusi recenzēšanas procesu un pašlaik tiek gaidīts galīgais redakcijas lēmums. 

Tāpat tika sagatavots PostDoc DPP dokuments, kas nosūtīts pārbaudei un plānots ievietošanai institucionālajā depozitārijā.

Projekta publicitātes nodrošināšanai pētniecības īstenošanas vietā ir izvietots informatīvs A3 formāta plakāts ar informāciju par projektu.

Laika posmā projektā turpinājās plānotās pētniecības aktivitātes, kas saistītas ar fenotipisko un ģenētisko datu iegūšanu, laboratorisko analīžu veikšanu un projekta rezultātu izplatīšanu zinātniskajā vidē.

2026. gada pirmajā ceturksnī Latvijas Aitu audzētāju asociācijas teķu nobarošanas stacijā “Klimpas” (Rūjienas novads) tika uzsākta jēru nobarošana kontrolētos apstākļos. Intensīvā nobarošana tiek īstenota saskaņā ar standartizētu metodiku, nodrošinot sistemātisku fenotipisko datu un bioloģisko paraugu ievākšanu. Intensīvi nobarotiem jēriem tiek veikta fenotipisko rādītāju mērījumi pirms nobarošanas uzsākšanas, venozo asins paraugu paņemšana un nogādāšana Latvijas Universitātē Genomikas un Bioinformātikas centra (GBC) laboratorijā. Paraugiem laboratorijā tiek veikta DNS izdalīšana un asins alikvotu uzglabāšana. 

Pārskata periodā Latvijas Universitātē Genomikas un Bioinformātikas centra laboratorijā tika turpināta DNS izdalīšana no saņemtajiem asins paraugiem, veikta to kvalitātes kontrole un uzsākta genotipēšana, izmantojot laboratorijā pieejamās molekulārās bioloģijas metodes. Paralēli tiek nodrošināta strukturēta paraugu un datu uzskaite, lai turpmākajos projekta posmos būtu iespējams integrēt genotipēšanas rezultātus ar nobarošanas izmēģinājumā iegūtajiem fenotipiskajiem un liemeņa kvalitātes rādītājiem.

Ņemot vērā projektā plānoto sinerģiju ar iepriekšējiem GBC projektiem (LZP No. lzp-2021/1-0489), pārskata laika periodā ir veikta Genomikas un Bioinformātikas centra esošās jēru paraugu sagatavošana un nodošana NeoGen Europe paraugu pilna genoma genotipēšanai ar GeneSeek® Genomic Profiler™ Ovine 50K Genotyping BeadChip, kas sevī ietver aptuveni 54tūkstošus lokusus aitu genomā. Gentipētajos paraugos ir ietverti arī pirmās nobarošanas paraugi.

Pārskates periodā ir arī saņemti genotipēšanas rezultāti, kuriem ir uzsākta datu pirmējā apstrāde un sagatavošana Pilna genoma saistības pētījumam (genome-wide association study (GWAS)) saistībā ar projekta atlasītajām fenotipiskajām pazīmēm jeb karkasa pazīmēm, tai skaitā kautmasu. GWAS analīzē tika veikta nozīmīgo lokusu atlase un provizoriskā prognozes modeļa izstrāde.

Projekta rezultāti pārskata periodā tika aktīvi izplatīti zinātniskajā vidē. 2026. gada aprīlī projekta rezultāti tika prezentēti Latvijas Universitātes 84. starptautiskās zinātniskās konferences apvienotajā Molekulārās bioloģijas sekcijas un Latvijas Bioķīmijas biedrības 9. konferences sēdē ar mutisku ziņojumu "Ar kautmasu saistītie genoma lokusi intensīvi nobarotiem dažādu Latvijā audzētu aitu šķirņu jēriem" (“Slaughter Yield–Associated Genomic Loci in Intensively Fattened Lambs Across Sheep Breeds Raised in Latvia”). 

Pārskata periodā tika sagatavots, iesniegts un apstiprināts abstrakts dalībai 77. Eiropas Dzīvnieku zinātnes asociācijas (EAAP) ikgadējā sanāksmē, kas notiks Hamburgā, Vācijā, ar postera prezentāciju "Ģenētiskie marķieri, kas saistīti ar kautmasu intensīvi nobarotiem Latvijā audzētiem jēriem" (“Genetic Markers Associated with Slaughter Yield in Intensively Fattened Lambs Raised in Latvia”). 

Paralēli rezultātu analīzēm tiek gatavots populārzinātniskais raksts, kas tiks iesniegts aitaudzētāju profesionāļiem domātā žurnālā.