Projekta nosaukums: Metode iekaisuma apjoma un līmeņa novērtējumam ādā, izmantojot plaša apgabala hiperspektrālo attēlošanu un atstarotās gaismas konfokālo mikroskopiju.

Projekta līguma numurs: 1.1.1.2/VIAA/4/20/665

Projekta vadītājs (pēcdoktorants): pētniece, Dr. Inga Saknīte

Projekta sadarbības partneri: Dr. Eric Tkaczyk, Vanderbilt Dermatology Translational Research Clinic (VDTRC.org), Vanderbilta Universitātes Medicīnas Centrs, Nešvila, Tenesī, ASV.

Projekta īstenošanas termiņš: 1.07.2021. - 30.06.2023.

Projekta kopējais finansējums, LU daļa: 89,203.92 EUR, LU daļa: 4,460.22 EUR

Projekta mērķis: Attīstīt metodi iekaisuma (eritēmas, apsārtuma) apjoma un līmeņa novērtējumam ādā, izmantojot neinvazīvu hiperspektrālo attēlošanu un atstarotās gaismas konfokālo mikroskopiju.

Projekta rezultāti: 2 publikācijas, 3 starptautisku zinātnisku konferenču tēzes, 1-4* mobilitātes komandējumi, 2-3* komunikācijas un sabiedrības iesaistes pasākumi, 3-6* zinātnisku semināru prezentācijas (*precīzs skaits atkarīgs no ceļošanas ierobežojumiem projekta izpildes laikā).

Kontaktinformācija: inga.saknite@lu.lv

I ceturksnis (01.07.2021. – 30.09.2021.)

Mobilitāte Vanderbilta Universitātes Medicīnas centrā (VUMC) Nešvilā, Tenesī štatā, ASV

  1. Ieguvu ētikas atļauju, lai veiktu klīniskus pētījumus VUMC.
  2. Izveidoju plānu trim klīniskajiem pētījumiem:
    • Iekaisuma apgabala noteikšana, izmantojot plaša apgabala hiperspektrālās attēlošanas sistēmu;
    • Mikroskopiska ādas audu morfoloģijas attēlošana iekaisuma līmeņa noteikšanai, izmantojot atstarotās gaismas konfokālo mikroskopu;
    • Mikroskopiska leikocītu-endotēlijšūnu mijiedarbības attēlošana virsējos ādas asinsvados iekaisuma līmeņa noteikšanai, izmantojot atstarotās gaismas konfokālo mikroskopu.
  3. Nokomplektēju plaša apgabala hiperspektrālās attēlošanas sistēmu, izmantojot  HinaLea 4200 hiperspektrālās attēlošanas kameru, gaismas diožu gredzenu EffiLux EFFI-Ring un statīvu.Testēju nokomplektēto sistēmu, veicot veselas ādas (bez iekaisuma) attēlošanu.
  4. Ieguvu klīniskos datus 5 pacientos ar ādas iekaisumu:
    • Izmantojot hiperspektrālo attēlošanu;
    • Izmantojot atstarotās gaismas konfokālo mikroskopiju.
  5. Prezentācija Vanderbilta Biofotonikas centra seminārā: “The reliability of annotations in 2D photos of 3D surfaces of the human body” (latviski: Anotāciju ticamība, izmantojot divdimensionālas fotogrāfijas trīsdimensionāla cilvēka ķermeņa attēlošanā).

II ceturksnis (01.10.2021. – 31.12.2021.)

Mobilitāte Vanderbilta Universitātes Medicīnas centrā (VUMC) Nešvilā, Tenesī štatā, ASV, līdz 2021. gada 23. novembrim

  1. Ieguvu klīniskos datus 3 hroniska ādas saimnieks-pret-transplantātu slimības (graft-versus-host disease, GVHD) pacientos ar akūtu slimību (iekaisumu), izmantojot hiperspektrālo attēlošanu. Kopumā līdz šim iegūti 8 pacientu dati (no 15). Zemā apgaismojuma dēļ, hiperspektrālo attēlu masīvus bija iespējams iegūt vien nelielam ādas apgabalam: 3x4 mm2. Pilotpētījumam šie dati būs noderīgi, lai novērtētu metodes efektifitāti izšķirt apsārtumu no pigmentācijas.
  2. Ieguvu klīniskos datus 10 GVHD pacientos ar akūtu slimību (iekaisumu), izmantojot atstarotās gaismas konfokālo mikroskopiju. Kopumā līdz šim iegūti 15 pacientu dati (no 30). Katram pacientam tika iegūti gan mikroskopiski 6x6 mm2 attēli četros dažādos ādas slāņos, gan arī 20 video dažādos 500x500 kvadrātmikronu reģionos 6x6 mm2 apgabalā apmēram 50 – 100 mikronus zem ādas virsmas. Kopējais video garums apmēram 10 minūtes.

Biofotonikas laboratorijā, Atomfizikas un spektroskopijas institūtā, Rīgā, Latvijā

  1. Hiperspektrālo datu analīze:
    1. Izveidoju hiperspektrālo datu analīzes plānu, kā arī izveidoju un testēju divus dažādus spektrālās analīzes algoritmus programmēšanas vidē Matlab: (a) izmantojot virsotņu komponenšu analīzes (vertex component analysis) metodi un (b) izmantojot ādas hromoforu kartēšanu un Bēra-Lamberta-Bugēra likumu. Abu algoritmu rezultāts ir izšķirti un kartēti trīs dažādi ādas apgabali: apsārtums (iekaisums), pigmentācija (paaugstināta vai pazemināta) un normāla āda. Kā standarts abu metošu rezultātu salīdzināšanai tiks izmantota apmācīta studenta (Shinwho Kwun, VUMC) anotācija, kas tiks uzskatīta par patiesu eritēmas un pigmentācijas sadalījumu katrā ādas attēlā. Salīdzinot algoritma kartēšanas rezultātu ar studenta manuālo anotāciju gan eritēmai, gan pigmentācijai, tiks iegūta algoritma precizitāti (accuracy). Tādējādi būs iespējams salīdzināt abus izveidotos algoritmus un izvēlēties algoritmu ar augstāko precizitāti klīnisko datu analīzei.
  2. Atstarotās gaismas konfokālās mikroskopijas datu analīze:
    1. Lai saprastu eritēmu (ādas iekaisumu) mikroskopiskā līmenī, tika izveidota metode mikroskopisko datu analīzei no ādas apsārtuma apgabaliem. Mikroskopiskie dati ir attēli 6x6 mm2 ādas apgabalam četros dažādos ādas slāņos: epidermas augšējais slānis, epidermas apakšējais slānis, epidermas-dermas robežslānis un augšējais dermas slānis. Balsotties uz histopatoloģijas iezīmēm, tika izveidots saraksts ar 18 dažādām mikroskopiskām ādas iekaisuma iezīmēm. Lai nebūtu jāanalizē katras iezīmes esamība vai neesamība visā 6x6 mm2 apgabalā katrā no 4 slāņiem, izveidoju metodi, kurā tiek izvēlēti divi 1.5x1.5 mm2 apgabali ar izteiktu dažādu morfoloģisku iezīmju esamību.
  3. Uzaicināts referāts (mutiska prezentācija) IX starptautiskajā fizikas konferencē par godu F. Pianca 2021. gada 22.-23. decembrī Rīgā, Latvijā (virtuāli) ar nosaukumu “Biophotonics for patient care: building a translational research team at a medical center in the United States” (Biofotonika pacientu aprūpei: starpnozaru pētniecības grupas izveide medicīnas centrā Amerikas Savienotajās Valstīs). Abstrakts konferences mājaslapā: 
  4. http://dragon.lv/F_Pianca/Abstracts/Inga_Saknite.pdf

2022. gada I ceturksnis (01.01.2022. – 31.03.2022.)

Biofotonikas laboratorijā, Atomfizikas un spektroskopijas institūtā, Rīgā, Latvijā

  1. Hiperspektrālo datu analīze:
    1. Testēju un veicu uzlabojumus spektrālās analīzes algoritmiem programmēšanas vidē Matlab: (a) izmantojot virsotņu komponenšu analīzes (vertex component analysis) metodi un (b) izmantojot ādas hromoforu kartēšanu un Bēra-Lamberta-Bugēra likumu. Abu algoritmu rezultāts ir izšķirti un kartēti trīs dažādi ādas apgabali: apsārtums (iekaisums), pigmentācija (paaugstināta vai pazemināta) un normāla āda.
  2. Atstarotās gaismas konfokālās mikroskopijas datu analīze:
    1. Izmantojot iepriekš izveidoto metodi, kurā katram ādas veidojumam tiek izvēlēti divi 1.5x1.5 mm2 apgabali ar izteiktu dažādu morfoloģisku iezīmju esamību, izanalizēju 5 pacientu datus. Novēroju morfoloģisku iezīmju esamību vai neesamību katrā 1.5x1.5 mm2 apgabalā, katrā no 4 ādas slāņiem.

Komandējums no 23.03.2022.

      3. Mutiska prezentācija Amerikas Dermatoloģijas Akadēmijas (American Academy of Dermatology) ikgadējā konferencē laikā no 25. – 29.03.2022. Bostonā, Masačūsetsā, ASV. Referāta nosaukums: Leikocītu-endotēlijšūnu mijiedarbība ādā paredz izdzīvošanas varbūtību pacientiem pēc cilmes šūnu transplanta (Cutaneous leukocyte-endothelial interactions predict outcomes after hematopoietic cell transplantation).
https://am2022.aad.org/sessions/3897

2022. gada II ceturksnis (01.04.2022. – 30.06.2022.)

Komandējums līdz 29.04.2022.

Mobilitātes vizīte (nr. 2) Vanderbilta Universitātes Medicīnas centrā (VUMC) Nešvilā, Tenesī štatā, ASV

  1. Ieguvu klīniskos datus 7 hroniska ādas saimnieks-pret-transplantātu slimības (graft-versus-host disease, GVHD) pacientos ar akūtu slimību (iekaisumu), izmantojot hiperspektrālo attēlošanu. Kopumā līdz šim iegūti 15 pacientu dati (no 15), un tādējādi hiperspektrālo datu ieguve ir pabeigta. Zemā apgaismojuma dēļ, hiperspektrālo attēlu masīvus bija iespējams iegūt vien nelielam ādas apgabalam: 3x4 mm2. Pilotpētījumam šie dati būs noderīgi, lai novērtētu metodes efektifitāti izšķirt apsārtumu no pigmentācijas.
  2. Ieguvu klīniskos datus 10 GVHD pacientos ar akūtu slimību (iekaisumu), izmantojot atstarotās gaismas konfokālo mikroskopiju. Kopumā līdz šim iegūti 25 pacientu dati (no 30). Katram pacientam tika iegūti gan mikroskopiski 6x6 mm2 attēli četros dažādos ādas slāņos, gan arī 20 video dažādos 500x500 kvadrātmikronu reģionos 6x6 mm2 apgabalā apmēram 50 – 100 mikronus zem ādas virsmas. Kopējais video garums apmēram 10 minūtes.

Dalība konferencēs

  1. Mutiska prezentācija (uzaicināta runa) konferencē Developments in Optics and Communications 2022 Rīgā, Latvijā (virtuāli), no 21. – 22.04.2022. Referāta nosaukums: Uz gaismu balstītas tehnoloģijas pacientu aprūpei: ādas analīze ar hiperspektrālo attēlošanu un atstarotās gaismas konfokālo mikroskopiju (Light-based technologies for clinical impact: hyperspectral imaging and reflectance confocal videomicroscopy of skin).
    Abstraktu grāmata (abstrakts 15. lapā)
    http://www.docriga.lv/assets/6260f16adef6e/Abstract%20book%20DOC%202022.pdf
     
  2. Mutiska prezentācija Optica Biofotonikas kongresā (Biophotonics Congress 2022) Fort Lauderdale, Floridā, ASV, no 24. – 27.04.2022. Referāta nosaukums: Imūno šūnu kustība, izmantojot atstarotās gaismas konfokālo videomikroskopiju, dod ieskatu par asins vēzi (Bedside reflectance confocal videomicroscopy of immune cell motion in skin provides blood cancer insights).
    https://www.optica.org/events/congress/biophotonics_congress_biomedical_optics/schedule/?day=Wednesday#TW3B.2
     
  3. Trīs plakātu prezentācijas konferencē Society of Investigative Dermatology Annual Meeting 2022 Portlendā, Oregonā (virtuāli) no 18. – 21.05.2022.
    https://www.sidannualmeeting.org/
    1. Saknite I, Gill M, Alessi-Fox C, Zwerner JP, Lehman JS, Shinohara MM, Novoa RA, Chen H,  Byrne M, Gonzalez S, Ardigo M, Tkaczyk ER, “In vivo reflectance confocal microscopy of cutaneous acute graft-versus-host disease: concordance with histopathology and interobserver reproducibility of a glossary with representative images,” poster #799 at the Society of Investigative Dermatology Annual Meeting, Portland OR, May 18-21, 2022.
    2. Saknite I, Patrinely JR, Zhao Z, Chen H, Kim TK, Jagasia M, Byrne M, Tkaczyk ER, “Cutaneous leukocyte-endothelial interactions predict outcomes after hematopoietic cell transplantation,” poster #806 at the Society of Investigative Dermatology Annual Meeting, Portland OR, May 18-21, 2022.
    3. McNeil A, Parks K, Liu X, Saknite I, Chen F, Reasat T, Wheless L, Dawant BM, Tkaczyk ER, “Segmentation of cutaneous chronic graft-versus-host disease by a deep learning neural network,” poster #805 at the Society of Investigative Dermatology Annual Meeting, Portland OR, May 18-21, 2022.

Biofotonikas laboratorijā, Atomfizikas un spektroskopijas institūtā, Rīgā, Latvijā

  1. Hiperspektrālo datu analīze:
    1. Izanalizēju 15 pacientu datus (no 15), izmantojot iepriekš izveidotos spektrālās analīzes algoritmus programmēšanas vidē Matlab: (a) izmantojot virsotņu komponenšu analīzes (vertex component analysis) metodi un (b) izmantojot ādas hromoforu kartēšanu un Bēra-Lamberta-Bugēra likumu. Abu algoritmu rezultāts ir izšķirti un kartēti trīs dažādi ādas apgabali: apsārtums (iekaisums), pigmentācija (paaugstināta vai pazemināta) un normāla āda.
       
  2. Atstarotās gaismas konfokālās mikroskopijas datu analīze:
    1. Izmantojot iepriekš izveidoto metodi, kurā katram ādas veidojumam tiek izvēlēti divi 1.5x1.5 mm2 apgabali ar izteiktu dažādu morfoloģisku iezīmju esamību, izanalizēju 5 pacientu datus (kopā izanalizēti 10 no 30 pacientu datiem). Novēroju morfoloģisku iezīmju esamību vai neesamību katrā 1.5x1.5 mm2 apgabalā, katrā no 4 ādas slāņiem.
    2. Izveidoju metodi video datu analīzei. Katram pacientam tika iegūti apmēram 20 video dažādos 500x500 kvadrātmikronu reģionos 6x6 mm2 apgabalā apmēram 50 – 100 mikronus zem ādas virsmas. Katra video garums apmēram 30 sekundes, līdz ar to kopējais video garums apmēram 10 minūtes katram pacientam. Katrā video tiek skaitīti leikocīti (baltie asinsķermenīši, imūnās šūnas), kas pieķeras asinsvada sieniņām (adherent) un kas veļas gar asinsvada sieniņu (rolling). Rezultātā katram pacientam tiek iegūts kopējais leikocītu un asinsvadu sieniņu mijiedarbību skaits.
       

Dalība semināros biofotonikas un datorzinātņu grupām Latvijā (2 prezentācijas) un ASV (1 prezentācija):

  1. Saknite I, McNeil AJ, Tkaczyk ER, “Ādas slimību analīze ar mākslīgo intelektu: pieredze Vanderbilta Universitātes Medicīnas centrā ASV,” Elektronikas un datorzinātņu institūta seminārs, Rīga, Latvija, 2022. gada 17. jūnijā.
     
  2. Saknite I, Patrinely JR, Zhao Z, Chen H, Beeghly-Fadiel A, Kim TK, Jagasia M, Byrne M, Tkaczyk ER, “Reflectance confocal microscopy of skin morphology & videomicroscopy of immune cells in microvessels of patients after stem cell transplant” (Atstarotās gaismas konfokālā mikroskopija ādas morfoloģiskai analīzei un videomikroskopija imūno šūnu kustības vizualizācija pacientos pēc cilmes šūnu transplanta), Vašingtonas Universitātes Prof. Jonathan Liu grupas seminārs (virtuāli), Sietla, Vašingtona, 2022. gada 15. jūnijā.
  3. Saknite I, Spigulis J, Tkaczyk ER, “Biofotonikas tehnoloģijas ādas attēlošanai: pieredze Vanderbilta Universitātes Medicīnas centrā ASV,” FOTONIKA-LV kolokvijs, Rīga, Latvija, 2022. gada 3. jūnijā.
     

Komunikācija ar sabiedrību:

Esmu sniegusi 2 video intervijas starptautiskās ziņu vietnēs, kas paredzētas plašākai publikai, tai skaitā, ārstiem un pacientiem.

  1. OncologyTimes:
    https://journals.lww.com/oncology-times/Fulltext/2022/04200/Key_Genomic_Alterations_in_Cutaneous_T_Cell.3.aspx
  2. HeamOnc Today:
    https://www.healio.com/news/hematology-oncology/20220509/10second-videos-help-predict-relapse-after-hematopoietic-stem-cell-transplantation

Esmu piedalījusies diskusijās ar dažādu specialitāšu ārstiem un medicīnas personālu (cilmes šūnu transplanta speciālistiem, hematologiem, onkologiem, pulmonologiem un dermatologiem):

  1. Saknite I, Patrinely JR, Zhao Z, Chen H, Beeghly-Fadiel A, Kim TK, Jagasia M, Byrne M, Tkaczyk ER, “Bedside reflectance confocal videomicroscopy of immune cell motion in skin provides blood cancer insights,” Tikšanās ar dermatoloģi Dr. Alina Markova no Memorial Sloan Kettering Cancer Center Ņujorkā, ASV (virtuāli), 2022. gada 22. jūnijā.
     
  2. Saknite I, Patrinely JR, Zhao Z, Chen H, Beeghly-Fadiel A, Kim TK, Jagasia M, Byrne M, Tkaczyk ER, “Bedside reflectance confocal videomicroscopy of immune cell motion in skin provides blood cancer insights,” Tikšanās ar cilmes šūnu transplanta speciālistu, hematologu, onkologu Dr. Sergio Giralt no Memorial Sloan Kettering Cancer Center Ņujorkā, ASV (virtuāli), 2022. gada 11. maijā.
     
  3. Saknite I, Patrinely JR, Zhao Z, Chen H, Beeghly-Fadiel A, Kim TK, Jagasia M, Byrne M, Tkaczyk ER, “Cutaneous leukocyte-endothelial interactions predict outcomes after hematopoietic cell transplantation,” Tikšanās ar pulmonologu Dr. Julie Bastarache un viņas grupu, Nešvila, Tenesī, ASV, 2022. gada 14. aprīlī.
     
  4. Saknite I, Patrinely JR, Zhao Z, Chen H, Beeghly-Fadiel A, Kim TK, Jagasia M, Byrne M, Tkaczyk ER, “Leukocyte-endothelial interactions in skin predict relapse and survival after hematopoietic cell transplantation,” Tikšanās ar cilmes šūnu transplanta speciālistiem, hematologiem, onkologiem Vanderbilta Universitātes Medicīnas centrā, Nešvila, Tenesī, ASV, 2022. gada 12. aprīlī.

Publikācija:

McNeil A, Parks K, Liu X, Saknite I, Chen F, Reasat T, Cronin A, Wheless L, Dawant BM, Tkaczyk ER. Artificial intelligence recognition of cutaneous chronic graft-versus-host disease by a deep learning neural network. British journal of haematology. 2022 Mar 24. https://doi.org/10.1111/bjh.18141

2022. gada III ceturksnis (01.07.2022. – 30.09.2022.)

Biofotonikas laboratorijā, Atomfizikas un spektroskopijas institūtā, Rīgā, Latvijā

  1. Atstarotās gaismas konfokālās mikroskopijas datu analīze: Izmantojot iepriekš izveidoto metodi, kurā katram ādas veidojumam tiek izvēlēti divi 1.5x1.5 mm2 apgabali ar izteiktu dažādu morfoloģisku iezīmju esamību, izanalizēju 5 pacientu datus (kopā izanalizēti 15 no 30 pacientu datiem). Novēroju morfoloģisku iezīmju esamību vai neesamību katrā 1.5x1.5 mm2 apgabalā, katrā no 4 ādas slāņiem.

Uzaicināta runa, komandējums no 18. – 21.09.2022. Korkā, Īrijā:

  1. Saknite I, Patrinely JR, Zhao Z, Chen H, Beeghly-Fadiel A, Kim TK, Jagasia M, Byrne M, Tkaczyk ER, “Light-based technologies for clinical impact: immune cells in skin reveal blood cancer insights,” Tyndall National Institute, Cork, Ireland, September 20, 2022.

Dalība semināros ASV:

  1. Saknite I, Patrinely JR, Zhao Z, Chen H, Beeghly-Fadiel A, Kim TK, Jagasia M, Byrne M, Tkaczyk ER, “Leukocyte-endothelial interactions in skin microvessels via videomicroscopy predict outcomes after hematopoietic cell transplantation,” Medical University of South Carolina (MUSC) Hematology-Malignancy team meeting, Charleston, Dienvidkarolīnā, ASV (virtuāli), 2022. gada 9. septembrī.

Esmu piedalījusies diskusijās ar ārsti radioloģi un viņas komandu:

  1. Saknite I, Patrinely JR, Zhao Z, Chen H, Beeghly-Fadiel A, Kim TK, Jagasia M, Byrne M, Tkaczyk ER, “Bedside videomicroscopy of leukocyte-endothelial interactions in skin to predict relapse and survival after hematopoietic cell transplantation,” Tikšanās ar radioloģi Dr. Yvonne Mowery no Duke University Durhamā, Ziemeļkarolīnā, ASV (virtuāli), 2022. gada 1. jūlijā.

Komunikācija ar sabiedrību:

Esmu piedalījusies Zinātnieku naktī 2022. gada 30. septembrī Latvijas Universitātes Zinātņu mājā Jelgavas ielā 3, Rīgā.

Publikācija:

McNeil AJ, House DW, Mbala-Kingebeni P, Mbaya OT, Dodd LE, Cowen EW, Nussenblatt V, Bonnett T, Chen Z, Saknite I, Dawant BM, Tkaczyk ER. “Counting Monkeypox Lesions in Patient Photographs: Limits of Agreement of Manual Counts and Artificial Intelligence,” Journal of Investigative Dermatology. 2022 Sep 15. PMID: 36116509.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9534148/

Publicētas konferenču tēzes:

  1. Saknite I, Gill M, Alessi-Fox C, Zwerner JP, Lehman JS, Shinohara MM, Novoa RA, Chen H,  Byrne M, Gonzalez S, Ardigo M, Tkaczyk ER, “In vivo reflectance confocal microscopy of cutaneous acute graft-versus-host disease: concordance with histopathology and interobserver reproducibility of a glossary with representative images,” poster #799 at the Society of Investigative Dermatology Annual Meeting, Portland OR, May 18-21, 2022.
  2. Saknite I, Patrinely JR, Zhao Z, Chen H, Kim TK, Jagasia M, Byrne M, Tkaczyk ER, “Cutaneous leukocyte-endothelial interactions predict outcomes after hematopoietic cell transplantation,” poster #806 at the Society of Investigative Dermatology Annual Meeting, Portland OR, May 18-21, 2022.
  3. McNeil A, Parks K, Liu X, Saknite I, Chen F, Reasat T, Wheless L, Dawant BM, Tkaczyk ER, “Segmentation of cutaneous chronic graft-versus-host disease by a deep learning neural network,” poster #805 at the Society of Investigative Dermatology Annual Meeting, Portland OR, May 18-21, 2022.

 

Last changed

Publicitāte


 

Projekta vadītāja, LU Atomfizikas un spektroskopijas institūta Biofotonikas laboratorijas vadošā pētniece Dr. Inga Saknīte aktīvi iepazīstina ieinteresētos ar savu projektu “Metode iekaisuma apjoma un līmeņa novērtējumam ādā, izmantojot plaša apgabala hiperspektrālo attēlošanu un atstarotās gaismas konfokālo mikroskopiju”. 2022. gada 3. jūnijā Dr. I.Saknīte uzstājās FOTONIKA-LV kolokvijā Šķūņu ielā 4, Rīgā. Prezentācijā ar nosaukumu “Biofotonikas tehnoloģijas ādas attēlošanai: pieredze Vanderbilta Universitātes Medicīnas centrā ASV” Dr. I. Saknīte stāstīja par saviem pēcdoktorantūras pētījumiem ādas attēlošanā. Izmantojot atstarotās gaismas konfokālo videomikroskopiju, Dr. I. Saknīte analizēja imūno šūnu kustību virsējos ādas asinsvados pacientos pēc cilmes šūnu transplanta.

2022. gada 17. jūnijā Latvijas Universitātes Atomfizikas un spektroskopijas institūta vadošā pētniece Dr. Inga Saknīte uzstājās Elektronikas un datorzinātņu institūta seminārā Dzērbenes ielā 14, Rīgā. Prezentācijas nosaukums: “Ādas slimību analīze ar mākslīgo intelektu: pieredze Vanderbilta Universitātes Medicīnas centrā ASV”.

Seminārā Dr. Saknīte dalījās pieredzē mākslīgā intelekta pielietojumos ādas slimību analīzei Dermatoloģijas departamentā, Vanderbilta Universitātes Medicīnas centrā, Nešvilā, Tenesī štatā, ASV. Dr. Saknīte stāstīja par dažādiem klīniskajiem izaicinājumiem, piemēram, apsārtuma robežu noteikšanā pacientos pēc cilmes šūnu transplanta. Viņa pastāstīja arī par ādas veidojumu segmentēšanu un skaitīšanu pacientiem ar pērtiķu bakām.

  1. McNeil A, Parks K, Liu X, Saknite I, Chen F, Reasat T, Cronin A, Wheless L, Dawant BM, Tkaczyk ER. Artificial intelligence recognition of cutaneous chronic graft-versus-host disease by a deep learning neural network. British journal of haematology. 2022 Mar 24.
  2. McNeil AJ, House DW, Mbala P, Tshiani O, Dodd L, Cowan E, Chen Z, Marks M, Saknite I, Tkaczyk E, Dawant B. Application of U-Net with Inceptionv4 Encoder for Localizing and Counting Monkeypox Lesions in Patient Photographs.
  3. Liu X, Parks K, Saknite I, Reasat T, Cronin AD, Wheless LE, Dawant BM, Tkaczyk ER. Baseline Photos and Confident Annotation Improve Automated Detection of Cutaneous Graft-Versus-Host Disease. Clinical hematology international. 2021 Sep;3(3):108.