Jaunā PĶR iekārta

Latvijas Universitātes pētniecības darbam iegādāta jauna, mūsdienīga polimerāzes ķēdes reakcijas (PĶR) iekārta. Tā būtiski palielinājusi molekulārās bioloģijas laboratoriju kapacitāti, tiek aktīvi izmantota pētniecības projektos un noslēguma darbu izstrādē.

Pateicoties LU fonda finansējumam 9999 eiro apmērā “MikroTik projektu konkursa pētniecības iekārtu iegādei dabas, tehnoloģiju un medicīnas zinātņu jomā” ietvaros, iegādāta 96 lauciņu iekārta VeritiProTM Thermal Cycler. Aprīkojums tiek izmantots pētniecības projektu un studiju darbu izstrādei LU Medicīnas un dzīvības zinātņu fakultātē (LU MDzF) un LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas institūtā (LU MBI). 

“Iekārta īpaša ar to, ka tā ne vien spēj ātri un precīzi veikt PĶR lielam paraugu skaitam, bet ir aprīkota arī ar temperatūras gradienta VeriFlex tehnoloģiju un touchdown PĶR funkciju, tādējādi ievērojami palielinot reakcijas specifiskumu un samazinot PĶR temperatūras optimizācijas laiku. Šāda iespēja nodrošina mazāku laika patēriņu reakcijas komponentu optimizācijas eksperimentos, kopumā paātrinot rezultātu ieguvi un tādējādi nodrošinot piekļuvi plašākam pētnieku lokam,” stāsta LU MDZF pētniece un doktorante Elza Kaktiņa. 

Bez PĶR veikšanas, kas ir viena no molekulārās bioloģijas un medicīniskās diagnostikas pamatmetodēm, mūsdienās nav iedomājama ne slimību diagnosticēšana, ne klonēšana vai sekvencēšana, pat ne patogēnu atklāšana vai tiesu medicīna. Šāda mūsdienīga iekārta būtiski palielina LU molekulārās bioloģijas laboratoriju kapacitāti, sniedzot iespēju ne tikai pētniekiem, bet arī doktorantūras un citu studiju līmeņu studentiem izstrādāt savus kvalifikācijas un noslēguma darbus bioloģijā un biotehnoloģijā.

Jau kopš jūnija iekārta tiek aktīvi izmantota vairākos pētniecības projektos un noslēguma darbu izstrādē, tai skaitā bakalaura un maģistra darbos – plašās lietošanas iespējas sniedz nozīmīgu ieguldījumu pētījumu īstenošanā.

Viens no projektiem, kura realizāciju nodrošina jauniegādātā iekārta, ir LU fonda administrētā “Jura Kalnavārna projektu konkursa dabaszinātņu un medicīnas nozarēs” finansētais pētījums "Atrast mazās baktērijas lielajos purvos: purva mikrobioma raksturošana”. Purvu bioloģiskā daudzveidība ir plaši aprakstīta un pētīta, tomēr iepriekšējie pētījumi nav apskatījuši mikrobiomu – mikroorganismu (baktēriju, sēnīšu, raugu, vīrusu u.c.) populācijas, kuras sastopamas jebkurā ekoloģiskajā nišā. Pateicoties jauniegādātajai iekārtai, pētnieki var noteikt purvu mikrobioloģisko daudzveidību, pavairojot un sekvencējot vides DNS. Šī pētījuma ietvaros doktora darba pētījumu “Jaunu dabasvielu atklāšana un raksturošana no Baltijas reģiona aktinobaktērijām” izstrādā doktorante Anitra Zīle. Viņa iekārtu izmanto, lai sagatavotu paraugus sekvencēšanai un mikroorganismu identifikācijai.

Iekārta tiek lietota arī Latvijas Zinātņu padomes projektos Nr. lzp-2023/1-026 “DNS marķieru izstrāde parastās rudzusmilgas (Apera spica-venti) sēklu noteikšanai augsnes sēklu bankā” un Nr. lzp-2022/1-0179 “Endofītiskās mikrobiotas loma melnā plūškoka Sambucus nigra L. iedarbībā pret A tipa gripas vīrusu un SARS-CoV-2".

Share