Marta Aizupiete dzimusi 1892. gadā 7. novembrī bijušajā Valkas apriņķī (tagad Gulbenes novads) Lejasciema pagastā zemnieku ģimenē.  
Pēc Valkas sieviešu ģimnāzijas beigšanas M. Aizupiete 1913. gadā uzsāka skolotājas darbu. 1917. gadā viņa iestājās Latvijas Sociāldemokrātiskajā strādnieku partijā (Latvijas Padomju partijā) kā aktīva biedre.  
1919. gadā M. Aizupiete evakuējās uz Krieviju. 1930. gadā viņa absolvēja Maskavas Valsts universitāti. Krievijā M. Aizupiete strādāja līdz 1944. gadam, jo viņa no Maskavas atgriezās Latvijā, būdama Padomju Sociālistisko Republiku Savienības (PSRS) Zinātņu akadēmijas vecākā zinātniskā līdzstrādniece. 
No 1950. gada līdz 1956. gadam viņa bija Pētera Stučkas Latvijas Valsts universitātes (LVU) Bioloģijas fakultātes Zooloģijas katedras vadītāja. Viņas pārziņā atradās arī Zooloģijas muzejs, kas tolaik bija šīs katedras sastāvdaļa. Pēc tam viņa kļuva par LVU Bioloģijas fakultātes Cilvēka un dzīvnieku fizioloģijas katedras vadītāju (no 1958.gada līdz 1961. gadam). No 1950. gada līdz 1960. gadam M. Aizupiete bija arī LVU Bioloģijas fakultātes dekāne. 
M. Aizupiete aizgājusi mūžībā 1975. gadā 19. novembrī pēc smagas slimības. 

LATVIJAS UNIVERSITĀTES RAKSTI.2017, 815. sēj. ZINĀTŅU VĒSTURE UN MUZEJNIECĪBA178.–199. lpp. https://doi.org/10.22364/luraksti.zvm.815.17

LU Muzejs, Zooloģijas kolekcijas

LU Bioloģijas fakultāte, Vēsture