“Latvijas Universitātes fonds” atbalsta Nanopore sekvencēšanas ieviešanu Latvijas Universitātes Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas institūtā (MBI).

Nanopore sekvencēšana ir jauna un, iespējams, ātrāk attīstošā sekvencēšanas tehnika. Šī metode var būt īpaši noderīga nezināmu genomu projektu sekvencēšanai vai specifisku aplikonu (aplikonu) sekvencēšanai.

Institūts uzvarēja “Latvijas Universitātes fonda” (fonds.lv) konkursu par Mikrotik dāvinājumu (fonds.lv/mecenati/platina/sia-mikrotikls), projekta vadītājs Jānis Liepiņš. Rezultātā tika iegādāts MinION ierīce, vairākas plūsmas šūnas (flow cells), sekvencēšanas komplekti, kā arī dators, pielāgots MinION datu iegūšanai un analīzei.

Plānots izmantot MinION ierīci šādos pētījumos:

  • Iepriekš slabo raksturoto rauga celmu sekvencēšana
  • Nepielīdzinātas rekombinācijas mutantu analīze
  • Vides mikroorganismu kopienu sekvencēšana
  • Specifisku aplikonu (applicon) sekvencēšana, kas nepieciešami metabolisma inženierijas eksperimentu atbalstam.
 

Dalīties

Back