Projekts „Latvijas starpaugstskolu zinātniskās grupas izveide sistēmbioloģijā”
Līguma Nr. 2009/0207/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/128
Projekta vadošais partneris: Latvijas Lauksaimniecības universitāte
Partneru līguma Nr. 04.4-08/EF4/1
Partneru līguma LU reģistrācijas Nr. ESS2009/91
Projekta izpildes termiņš: 2009.gada decembris – 2012.gada novembris
Projekta kopējais finansējums: 1 380 000 LVL
Projekta zinātniskais vadītājs: Egils Stalidzāns, Latvijas Lauksaimniecības Universitāte
Projekta administratori LU: Inesa Marhele, tālr. 67034403, e-pasts inesa.marhele@lu.lv; Inna Mina, tālr. 67034404, e-pasts inna.mina@lu.lv

Projekta laikā tiek veidota Latvijā pirmā zinātniskā grupa jaunā, pasaulē strauji augošā zinātņu nozarē sistēmbioloģijā. Grupā sadarbosies informācijas tehnoloģiju speciālisti (LLU Informācijas Tehnoloģiju fakultāte), biologi (LU Bioloģijas fakultāte un LU Mikrobioloģijas un Biotehnoloģijas institūts) un biotehnoloģisko procesu inženieri (RTU Materiālzinātnes un lietišķās ķīmijas fakultāte).

Projekta mērķis – piesaistīt cilvēkresursus zinātnei, veidojot starpdisciplināru grupu sistēmbioloģijā, kurā sadarbosies datormodelētāji ar eksperimentātoriem.

Pētījuma virziens - dinamisku, kvantitatīvu datormodeļu izveide, optimizācija un pielietojums raugu un baktēriju metaboliskajā inženierijā, biotehnoloģisko procesu projektēšanā un to vadības izstrādē. Eksperimenti tiks balstīti nevis uz aprakstošiem priekšstatiem par mikroorganismu metabolismu, bet gan uz detalizētiem metabolisma datormodeļiem.

Projekta zinātniskā aktualitāte – uz kvantitatīvu dinamisku šūnas molekulāro procesu modeli balstīta producentu fizioloģijas un biotehnoloģijas jautājumu risināšana, sākot ar modeļa izveidi, turpinot ar tā parametrisko un strukturālo optimizāciju un beidzot no modeļa izrietošas pilotmēroga ražošanas tehnoloģijas izstrādi. Pētījums attiecas uz datormodelēšanas un optimizācijas algoritmu pielietojumu mikroorganismu metaboliskajā inženierijā. Pētījumu rezultātā tiks mērķtiecīgi izmainīts mikroorganismu celmu metabolisms, uzlabojot to fizioloģiskās īpašības, paaugstinot to produktivitāti, un radot jaunus procesus biodegvielu ražošanas, atkritumu pārstrādes, bioloģiski aktīvo vielu biosintēzes un citās jomās.

Pagaidām Latvijā nedarbojas neviena pilnvērtīga sistēmbioloģijas grupa, kurā iesaistīti gan datormodelētāji, gan eksperimentātori. Kopš 2006. gada sistēmbioloģijas pieejas nozīmību un perspektīvas savās publikācijās akcentē šī projekta vadītāja Dr.sc.ing. Egila Stalidzāna izveidotā Biosistēmu grupa (LLU), kurā darbojas bioprocesu datormodelēšanas speciālisti. Biotehnoloģisko producentu fizioloģijas un metaboliskās inženierijas speciālisti, kuri pārstāvētu sistēmbioloģijas eksperimentālo pusi, tiks piesaistīti no LU. Savukārt, procesu rūpnieciskās ieviešanas problēmas risinās RTU biotehnoloģisko iekārtu inženieri. Ar vēl vienu sadarbībai nepieciešamo priekšnosacījumu – strapdisciplināro izglītību sistēmbioloģijā Eiropas mērogā – nodarbojas LLU Biosistēmu grupas koordinētais Eiropas mūžizglītības programmas projekts MOSBIO (www.mosbio.eu). Projektu nepieciešams realizēt, lai, finansējot starpaugstskolu sadarbību, uz esošā zinātniskā potenciāla bāzes izveidotu jaunu zinātnes virzienu Latvijā, liekot pamatus doktorantūras skolai, uz inovācijām balstītai ilgtspējīgai biotehnoloģijas attīstībai, un tādējādi nodrošinot darbavietas zinātnē un uz zināšanām balstītā bioekonomikā.

Sagaidāmie rezultāti – jauns zinātnes virziens Latvijā, kurš nodrošinās darbavietas uz zināšanām balstītā bioekonomikā; rekombinantie mikroorganismu celmi, datormodeļi un algoritmi, publikācijas un semināri sistēmbioloģijā. Projekta iesniedzējs – LLU, sadarbības partneri – LU un RTU. Projekts tiks realizēts no 2009. līdz 2012. gadam Jelgavā un Rīgā.