Projekts Agrīnas audzēju diagnostikas un novēršanas starpdisciplināra izpētes grupa
Līguma Nr. 2009/0220/1DP/1.1.1.2/09/APIA/VIAA/016
LU reģistrācijas Nr. ESS 2009/83
Projekta izpildes termiņš: 2010.gada 1.janvāris – 2012.gada 31.decembris
Projekta kopējais finansējums: 1 400 300 LVL
Projekta zinātniskais vadītājs: Mārcis Leja, e-pasts: cei@latnet.lv; +371 29497500
Projekta administratīvais vadītājs: Mairita Kruka Zalcmane

Projekta mērķis ir izveidot Latvijā starptautiski atpazīstamu multidisciplināru zinātnieku grupu pētnieciskajam darbam ļaundabīgu slimību un pirmsvēža stāvokļu izpētes jomā. Mērķa sasniegšanai tiks apvienoti valsts augstskolu (Latvijas Universitāte, Daugavpils Universitāte), valsts zinātniskas institūcijas (LU Biomedicīnas Pētījumu un studiju centrs) un augstskolas institūta (LU aģentūra „Matemātikas un informātikas institūts”) resursi, paredzēts piesaistīt arī vadošo medicīnas institūciju (komersantu) resursus gan Rīgā, gan arī Latgales reģionā.

Paredzēts, ka zinātnieku grupai, kuras sastāvā būs medicīnas, bioloģijas, matemātikas, informācijas tehnoloģiju, ekonomikas speciālisti un sociologi, jānodrošina ilgtspējīga zinātnisko aktivitāšu attīstība ļaundabīgo slimību un pirmsvēža stāvokļu izpētes jomā.

Projekta zinātniskās aktivitātes vērstas skrīninga programmu kompleksa izvērtējuma un skrīninga programmu optimizācijas iespēju izpētes virzienā un biomarķieru diagnostikas attīstības virzienā ļaundabīgo slimību un pirmsvēža stāvokļu savlaicīgai noteikšanai. Tiks pētīta arī ģenētisko faktoru lomu atsevišķu ļaundabīgu slimību gadījumā. Tiks izveidots biobankas modelis un atbilstošā programmatūra, kas nodrošinās gan pētījumu veikšanu, gan projekta rezultātu ilgtspēju arī pēc tā realizācijas beigām. Būtiski jauni pētījumu dati (t.sk. par skrīningu) tiks iegūti, veicot socioloģisko un ekonomisko izpēti un analīzi.

Projekta realizācija paredzēta 36 mēnešu periodā, norises vietas – Rīga, Daugavpils, taču projektā tiks izmantota materiāls un informācija par pacientiem no visas Latvijas.

Projekta aktivitāšu galvenie rezultāti tieši vērsti uz zinātnisko aktivitāšu turpināšanu nākotnē, konkrēti (zinātniskie aspekti):

• projekta ietvaros paredzēts izveidot biobanku, kuras izmantošanas galvenais uzdevums ir zinātnisku pētījumu piesaistīšana un realizēšana Latvijā;
• izveidotā datu bāze atļaus uzlabot pieejamā materiāla izmantojamību zinātniskajiem mērķiem (precīza informācija par iekļauto materiālu);
• paredzams, ka organizētā skrīninga izmantošana turpināsies un paplašināsies, tādējādi nepieciešamība pēc projekta rezultātiem (iestrāžu turpināšanas) pat palielināsies pēc projekta beigām;

socioloģiskie dati būs izmantojami gan plānošanai, gan salīdzināšanai nākotnē; papildus salīdzinošie dati būs nepieciešami turpmāk pasākumu ietekmes uz attieksmi analizēšanai (t.sk. skrīninga atbalsta kampaņu efekta analīzei).

Projekta otrajā ceturksnī  ir veiktas sekojošas lietas:

Aktivitātē Biobankas modeļa izstrāde ir turpināts darbs pie likumdošanas datu analīzes; uzsākta starptautiski atpazītu biobanku dokumentācijas analīze un analizēta pieredze Porto (Portugāle) slimnīcas biobankā.

Aktivitātē ļaundabīgo saslimšanu skrīninga analīze.

Pārskata periodā paveikts sekojošais:

• Turpināts darbs epidemioloģisko datu analīze, t.sk. publikāciju sagatavošanā;
• Aktīva dalība kolorektālā vēža mēneša (marts) ietvaros, t.sk. līdzdalība preses konferencēs, zarnas modeļa demonstrācijās, u.c.
• Turpināts darbs pie metodiskās plānošanas skrīninga pilotpētījumam;
• Veikti ziņojumi vairākās konferencēs, t.sk. Veselības ministrijā, Baltijas Onkologu konferencē, Centrāleiropas gastroenteroloģijas konferencē.

Aktivitātē Biomarķieru diagnostikas, ģenētisko riska faktoru un pirmsvēža stāvokļu pētījumi.

• 2.3.1.apakšaktivitāte.„Ar paaugstinātu risku saistīto ģenētisko mutāciju analīze (BRCA1)”. Datu bāzē iekļautas ~ 85 krūts vēža pacientes.
• Dalība 5. Baltijas onkologu kongresā ar mutisku ziņojumu „Problems concerning the breast cancer in Latvia” (J.Eglitis, M.Timofejevs, I.Mandrika, A.Stengrevics, L.Tihomirova), Mutisks ziņojums Lietuvas Senoloģijas biedrības ikgadējā sēdē 28.05.10. „ Breast cancer in Latvia: Where are we” (J.Eglītis)

Aktivitātē socioloģiskā analīze ir veikta literatūras analīze un metodoloģijas izstrāde. Literatūras studiju ietvaros pabeigts darbs pie dažādu akadēmisko pilnu tekstu datubāzēs un dažādu institūciju mājas lapās atlasīto datu avotu klasificēšanas un analīzes. Katrs darbinieks iegūto datu avotu klasifikāciju un analīzi veica atbilstoši saviem darba uzdevumiem un pētījuma mērķiem. Aplūkojot tādus datu avotus kā iepriekš pasaulē un Latvijā veiktie pētījumi uzmanība tika pievērsta ne vien galvenajiem secinājumiem, bet arī izstrādātajai metodoloģijai, izlases veidošanas principiem, respondentu atlases stratēģijām un tām grūtībām, ar kurām saskārušie pētījumu autori to tapšanas gaitā. Darbs pie metodoloģijas izstrādi nav uzsākts, jo teorētiskās daļas izstrādei nepieciešams bija ilgāks laiks.

Uzsākts darbs pie pētījuma teorētiskās daļas sagatavošanas. Pētījuma teorētiskajā daļai tie gatavotas trīs nodaļas, kas ietvers (1) esošās situācijas raksturojumu par saslimstību ar ļaundabīgiem audzējiem un par Latvijas skrīninga sistēmu, (2) apkopojumu par vēža skrīninga apmeklēšanu ietekmējošiem faktoriem, kā arī (3) komunikācijas nozīmes atainojumu vēža skrīninga apmeklēšanas veicināšanā.

Rezultāti :

1. izstrādāts literatūras apskats un sagatavots ziņojums.
2. vēža skrīninga izpētes daļā sagatavotas 3 teorētiskās nodaļas, kas nodotas izskatīšana projekta skrīninga speciālistiem un darba grupām. Nodaļas papildinātas.

Plānotais turpmākajā periodā:

• pētījuma teorētiskās daļas sagatavošana,
• metodoloģijas izstrāde,
• pilotinterviju veikšana pētījuma instrumentārija kvalitātes un atbilstības novērtēšanai;
• lauka darba organizēšana un uzsākšana.

Aktivitātē: Programmatūras izstrāde, datu analīze.

Turpināts darbs pie esošo programmatūras risinājumu (SimBioMS, uz RDF un OWL tehnoloģijām balstītas datu bāzes) piemērotības izvērtējuma biobankas izveidei.     

Veikts darbs pie datu bāzes struktūras projektēšanas, GRADE programmā zīmētas ontoloģijas.

Veikts darbs pie uz SIMBioMS tehnoloģijām balstītas datu bāzes demo versijas izstrādes un tās konfigurācijas, balstoties uz esošiem datiem.

Rezultāti:

1. ziņojums par esošās programmatūras risinājumu (SimBioMS, uz RDF un OWL tehnoloģijām balstītas datu bāzes) piemērotības izvērtējumu biobankas izveidei.
2. veikta datu bāzes struktūras projektēšana un izveidoti datu lauku apraksti.
3. veikta izstrādātās uz SIMBioMS tehnoloģijām balstītās datu bāzes demo versijas testēšana.

Aktivitātē Ekonomiskā analīze un modelēšana.

2.6.1. Skrīninga efektivitātes analīze. Apakšaktivitātes ietvaros bija plānots izstrādāt koncepciju par netiešās efektivitātes (zaudējumu) noteikšanu novēlotas ārstēšanas un letāliem gadījumiem.

Rezultāts – izstrādāta koncepcija.

2.6.3. Literatūras analīze. Apakšaktivitātes ietvaros bija plānots studēt literatūru par skrīninga un ārstēšanas metodēm, praksi, rezultātiem un literatūru par skrīninga un ārstēšanas efektivitātes jautājumiem pa slimību veidiem.

Rezultāts - ir studēta atbilstošā literatūra un sagatavots literatūras analīzes pārskats.

2.6.5. Kolorektālā vēža skrīninga izmaksu analīze. Apakšaktivitātes ietvaros bija plānots izstrādāt algoritmu (modeli) profilakses un ārstēšanas izmaksu un efektivitātes noteikšanai.

Rezultāts- izstrādāts algoritms.

Plānotais nākamajā periodā: